El Programa de Ingeniería Agronómica del Decanato de Agronomía con el objeto de adecuar su función administrativa reestructuró en el año 1999 la organización de las unidades académicas. Este cambio consistió en la integración de los múltiples departamentos heredados del viejo pensum en nuevos que concordaran con los ejes curriculares del programa vigente de la carrera. Es así como los departamentos de Botánica, Agrobiológico y Entomología-Zoología se fusionaron en el Departamento de Ciencias Biológicas.